De algemene vergadering telt 56 leden en komt twee keer per jaar bijeen. Het belangrijkste agendapunt is doorgaans de goedkeuring van het jaarverslag en de jaarrekening (in het voorjaar) en de goedkeuring van de begroting (in december).
Raad van bestuur
De raad van bestuur wordt gekozen door de Algemene Vergadering. Hij telt 33 leden, van wie er 27 de gemeenten vertegenwoordigen. Gemeenteraadsleden die lid van de raad van bestuur zijn, hebben tegelijk ook zitting in een regionaal comité.
Directiecomité
Uit de raad van bestuur wordt een directiecomité gekozen dat 10 leden telt. Het directiecomité is verantwoordelijk voor het dagelijks bestuur.
Regionale comités
Wvi heeft 3 regionale comités: voor de Westhoek, voor de arrondissementen Roeselare-Tielt en voor de arrondissementen Brugge-Oostende. Ze geven advies aan de raad van bestuur en het directiecomité. Afhankelijk van hun kapitaalsinbreng in de wvi kunnen gemeenten 1 of meer gemeenteraadsleden afvaardigen. In elk regionaal comité heeft de Provincie 6 vertegenwoordigers. De comités komen 4 keer per jaar samen.
Een volledig overzicht van de bestuursorganen vindt u hier